Az alábbi ábrákon a Grand Theft Auto Vice City Stories irányítása látható, mind a PlayStation Portable, mind a PlayStation 2 verzióhoz. Bár a játék kezdettől fogva tájékoztat minket a gombok funkcióiról, ez a leírás hasznos lehet azok számára, akik talán most kezdenek el játszani a Vice City Stories-zal. Az irányítás itt is hasonló a többi GTA konzolos vezérléséhez, mindenesetre érdemes tisztában lenni ezekkel a játék megkezdése előtt.
A játék alapbeállításban a Setup 1 nevű funkciókiosztást használja, és talán ez a legelőnyösebb kiosztás a GTA játékokhoz. Ha ez valakinek mégsem tetszene, lehetőség van egy Setup 2 nevezetű beállításra is, mely csupán a kamerakezelést változtatja meg, mikor járművet vezetsz. Mindkét kiosztás (Setup 1, Setup 2) tartamaz egy-egy alternatív beállítást is, mely az iránygombok (D-Pad) és az analog stick funkcióinak felcserélését jelenti.
Az egyes gombok, más-más környezetben különböző funkciókat látnak el, éppen ezért kategóriákra osztottuk a táblázatokat. Ebben a cikkben csak a Setup 1 beállításait láthatod, ha a Setup 2-re is kíváncsi vagy, azt megnézheted a játék menüjében. Előfordulhat, hogy néhány funkció csak speciális esetben működik. Ilyenkor a táblázat alatti lábjegyzetben olvashatod el az ahhoz tartozó megjegyzést, számmal jelölve.
Gyalog
Értelemszerűen először gyalog kezded a játékot. Ez azt jelenti, hogy karaktered nem ül semmilyen járműben, csupán a két lábán áll. A fegyverekkel kapcsolatos funkciók is ide kerültek.
| Funkció | PSP | PS2 | 
| Mozgás | Analog Stick | Bal Analog Stick | 
| Kamera forgatása |  + Analog Stick | Jobb Analog Stick | 
| Sprint (1) |  |  | 
| Ugrás |  |  | 
| Beszállás a járműbe |  |  | 
| Következő fegyver |  |  | 
| Előző fegyver |  |  | 
| Automatikus célzás |  |  | 
| Váltás a célpontok közt (2) |   |   | 
| Támadás az aktuális fegyverrel |  |  | 
| Szabad célzás (3) |  +  | L3 +  | 
| Előre nézés |  |  | 
| Hátra nézés |  +  | R3 | 
| Közelítés (4) |  |  | 
| Távolítás (4) |  |  | 
| Fénykép készítése (5) |  |  | 
| Szünet menü | Start |  | 
| Kameranézet váltása | Select |  | 
(1) Ha túl sokáig sprintelsz, karaktered előbb-utóbb elfárad, így pihennie kell egy kicsit. Minél többet futsz, annál nagyobb lesz az állóképességed, de ha teljesíted a mentős küldetéseket, végtelen ideig sprintelhetsz.
(2) Csak automatikus célzás közben lehetséges.
(3) A lenyomás után az R illetve R1 gombokat nyomva kell tartani, majd a bal oldalon lévő Analog Stick segítségével lehet a célkeresztet irányítani.
(4) Csak a fényképezőgép, távcső és mesterlövész puskák célzása esetén lehetséges.
(5) Csak a fényképezőgépnél lehetséges.
Közelharc
Ha puszta kézzel, vagy boxerrel támadsz meg valakit, többféle trükköt is bevethetsz. Fontos, hogy ezekhez először be kell céloznod az ellenfelet. Ezután a következő lehetőségeid vannak:
 - Erős támadás (2 mozdulat)
 - Erős támadás (2 mozdulat) - Gyenge támadás (4 mozdulat)
 - Gyenge támadás (4 mozdulat) - Fogás (Elölről vagy hátulról)
 - Fogás (Elölről vagy hátulról) - Védekezés
 - Védekezés - Nagyon erős ütés
 - Nagyon erős ütés - Ütés fejbe és hasba
 - Ütés fejbe és hasba - Dobás
 - Dobás - Térdelés a hátba
 - Térdelés a hátba - Ütés a fejbe
 - Ütés a fejbe - Nyak eltörése
 - Nyak eltörése - Taposás, Rúgás
 - Taposás, Rúgás - Ütés
 - Ütés - Ellenfél felhúzása
 - Ellenfél felhúzása - Taposás, Rúgás
 - Taposás, RúgásBiciklizés
Egy másik újítás az eredeti Vice City-hez képest, hogy a játékban akár bicajozhatunk is. Több verseny is van, melyeket kerékpárral kell teljesítenünk, tehát jobb, ha előre begyakoroljuk a vezetését. A San Andreas-szal ellentétben itt nem lehet növelni a kerékpározási képességünket, de ugrani például ismét lehet. A következő gombokat használhatjuk biciklizés közben:
| Funkció | PSP | PS2 | 
| Pedálozás |  (Nyomvatartva) |  (Nyomvatartva) | 
| Gyorsabb tekerés (1) |  (Nyomogatva) |  (Nyomogatva) | 
| Fék |  |  | 
| Fék, Tolatás |  |  | 
| Ugrás [Bunnyhop] (2) |  |  | 
| Balra nézés |  + Analog Stick balra |  | 
| Jobbra nézés |  + Analog Stick jobbra |  | 
| Hátra nézés |  + Analog Stick le |  +  | 
| Lövés (3) |  |  | 
| Leszállás a bicikliről |  |  | 
(1) A mentős küldetések teljesítésével végtelen ideig lehet gyorsan tekerni.
(2) Ha hosszabban nyomod a gombot, karaktered magasabbra ugrik.
(3) Csak géppisztolyokkal lehetséges. Balra illetve jobbra nézés közben is lehet lőni.
Úszás
Ahogy azt már az Alapok cikkben is részletesen kitárgyaltuk, a Vice City Stories-ban ismét lehetőségünk van úszni.
| Funkció | PSP | PS2 | 
| Mellúszás | Analog Stick | Bal Analog Stick | 
| Kamera forgatása |  + Analog Stick | Jobb Analog Stick | 
| Hátra nézés |  +  | R3 | 
| Gyorsúszás |  |  | 
| Kimászás a vízből |  |  | 
| Beszállás hajóba vagy Skimmer-be |  |  | 
Autóban, Motoron, Hajókon és JetSki-n
A számos jármű mellett néhány újjal is találkozhatunk a Vice City Stories-ban. Ilyen például a hatkerekű kétéltű, a Splitz 6 ATV vagy a gyors vizijármű, a JetSki. A kategória címeként felsorolt négy járműtípusnak nagyjából ugyanazok az irányításai.
| Funkció | PSP | PS2 | 
| Kormányzás (1) | Analog Stick | Bal Analog Stick | 
| Gáz |  |  | 
| Kézifék |  |  | 
| Fék, Tolatás |  |  | 
| Lövés (2) |  |  | 
| Kiszállás a járműből |  |  | 
| Balra nézés |  + Analog Stick balra |  | 
| Jobbra nézés |  + Analog Stick jobbra |  | 
| Hátra nézés |  + Analog Stick le |  +  | 
| Duda vagy sziréna (3) |  | L3 | 
| Rádióadó váltása |   |  | 
| Speciális küldetés elindítása (4) |  | R3 | 
| Szünet menü | Start |  | 
| Kameranézet váltása | Select |  | 
(1) Motoron hátrahúzás esetén kerekelni, előretolás és fék lenyomása esetén elsőkerekezni lehet.
(2) Motoron és JetSki-n előre is lehet lőni, autóban és hajókon csak a balra illetve jobbra nézés közben.
(3) Sziréna csak a közszolgálati járművek nagy részében van. Ha egyszer megnyomod, bekapcsol. Ha szirénázás alatt nyomva tartod, akkor hangot vált. Ha kikapcsolt állapotban tartod nyomva, akkor dudál.
(4) Bővebben lásd a mellékküldetéseknél.
Helikopter irányítása
Ismét több helikoptert is vezethetünk a játékban, legtöbbjükkel ráadásul versenyeket is teljesíthetünk. Bár konzolon könnyebb a rotoros gépek irányítása, mégis jó ha tisztában vagyunk vele, hiszen nem egy küldetésben lesz rá szükség. Fontos megjegyezni, hogy a Hunter irányítását külön kategóriába foglaltuk.
| Funkció | PSP | PS2 | 
| Dőlés (előre, hátra, jobbra, balra) | Analog Stick | Bal Analog Stick | 
| Vízszintes forgás |   |   | 
| Emelkedés |  |  | 
| Süllyedés |  |  | 
| Lebegés | --- | L3 | 
| Tüzelés a gépágyúval (1) |  |  | 
| Kiszállás a helikopterből |  |  | 
| Rádióadó váltása (2) |   |  | 
| Speciális küldetés elindítása (3) |  | R3 | 
| Szünet menü | Start |  | 
| Kameranézet váltása | Select |  | 
(1) Csak a Little Willie és Sea Sparrow esetében működik.
(2) A Hunter-en kívül csak a VCPD Maverick nem rendelkezik zenét sugárzó rádióval.
(3) Csak az "Air Rescue" mellékküldetés esetében működik, de a "Vice Sights" illetve "Fire Copter" feladatok deaktiválására is használható.
Repülés
A játékban két repülő van: a Skimmer és a Biplane. Ezeknek külön irányításuk van, bár kicsit hasonlít a helikopterekéhez.
| Funkció | PSP | PS2 | 
| Süllyedés | Analog Stick fel | Bal Analog Stick fel | 
| Emelkedés | Analog Stick le | Bal Analog Stick le | 
| Balra dőlés | Analog Stick balra | Bal Analog Stick balra | 
| Jobbra dőlés | Analog Stick jobbra | Bal Analog Stick jobbra | 
| Balra fordulás (Biplane) |  |  | 
| Jobbra fordulás (Biplane) |  |  | 
| Gáz |  |  | 
| Lassítás |  |  | 
| Kiszállás a gépből |  |  | 
| Rádióadó váltása |   |  | 
| Speciális küldetés leállítása (1) |  | R3 | 
| Szünet menü | Start |  | 
| Kameranézet váltása | Select |  | 
(1) Ha éppen verseny alatt vagy a repülővel, ezzel állíthatod le a versenyt.
Rhino tank irányítása
Természetesen a Vice City Stories-ból sem maradhatott ki a Rhino tank. Ha tankot vezetsz, a következő lehetőségeid vannak az irányításra:
| Funkció | PSP | PS2 | 
| Kormányzás | Analog Stick | Bal Analog Stick | 
| Gáz |  |  | 
| Kézifék |  |  | 
| Fék, Tolatás |  |  | 
| Löveg irányítása |   | Jobb Analog Stick | 
| Lövés az ágyúval |  |  | 
| Kiszállás a járműből |  |  | 
| Balra nézés |  + Analog Stick balra |  | 
| Jobbra nézés |  + Analog Stick jobbra |  | 
| Hátra nézés |  + Analog Stick le |  +  | 
| Duda |  | L3 | 
| "Vigilante" küldetés elindítása |  | R3 | 
| Szünet menü | Start |  | 
| Kameranézet váltása | Select |  | 
Hunter irányítása
Mivel a Hunter helikopter egy fegyverekkel felszerelt katonai jármű, kissé eltér az irányítása a többi helikopterétől.
| Funkció | PSP | PS2 | 
| Dőlés (előre, hátra, jobbra, balra) | Analog Stick | Bal Analog Stick | 
| Vízszintes forgás |   |   | 
| Emelkedés |  |  | 
| Süllyedés |  |  | 
| Lebegés | --- | L3 | 
| Tüzelés a gépágyúval |  +  |  | 
| Rakéta lövése |  |  | 
| Kiszállás a helikopterből |  |  | 
| "Vigilante" küldetés elindítása |  | R3 | 
| Szünet menü | Start |  | 
| Kameranézet váltása | Select |  |